Под властью Габсбургов
Со времени Фердинанда II автономия Богемии упраздняется и она поглощается Австрией. Дальнейший шаг к слиянию Габсбургских земель в одно государственное целое был сделан прагматической санкцией 19 апреля 1713 года, которой, помимо определения порядка престолонаследия, было установлено, что все наследственные земли Габсбургского дома должны оставаться соединёнными под властью одного государя до прекращения этого дома и отнюдь не могут быть делимы между его членами. Чешский сейм принял эту санкцию в 1720 году.
В 1749 году императрица Мария-Терезия повелела соединить чешскую и преобразованную австрийскую канцелярии в одно общее государственное учреждение с административным и финансовым ведомством (diréctorium in publico-politicis et camerabilus), причём заведование внешними сношениями предоставлено было придворной и государственной канцелярии, а для заведования судебными и юридическими делами учреждено высшее юридическое ведомство, при котором организована особая законодательная комиссия. В том же году было уничтожено наместничество, как орган сословного управления, а вместо него основано новое учреждение для управления административно-политического и финансового: королевская репрезентация и камера. Членами этого учреждения, переименованного (1762—1763 гг.) в земскую губернию, были уже не земские сановники и судьи, назначаемые по старине из среды земской высшей и низшей шляхты, а государственные чиновники. Уничтожение чешской придворной канцелярии было торжеством австрийской централизации, а отмена наместничества знаменовала введение бюрократии. Император Иосиф II в 1783 г. уничтожил старинные земские и другие суды и ввёл новую систему судоустройства, основанную на принципе разделения властей административной и судебной.
При императоре Леопольде II был до некоторой степени восстановлен старый земский порядок управления в том отношении, что земские сановники были назначены председателями новых учреждений: высший бургграф — председателем «губернии», высшийкоморник — вице-председателем её, высший гофмейстер — председателем апелляционного суда и т. д. Такой порядок сохранялся до 1848 г. В организации сейма со времени Фердинанда II произошло сравнительно мало перемен. В 1714 г. была учреждена восьмичленная сеймовая комиссия (vý bor zemský), п о 2 члена от каждого из четырёх государственных сословий, постоянно заседавшая и заведовавшая сеймовыми делами, а особенно сбором берны и отчётом по её взиманию. Хотя, кроме права вотировать налоги и давать согласие на отчуждение коронных имений, сейм с течением времени приобрёл до некоторой степени право законодательной инициативы, но у сословий не хватало ни единодушия, ни сознания общеземских нужд, ни уменья их отстаивать, а потому правительство считалось с сеймом и его сословиями в той мере, в какой ему было угодно. Усиление централизации и развитие бюрократизма сопровождалось нарушением прав короны св. Вацлава.
Реформами XVIII века была уничтожена связь между землями чешской короны: в 1745 г. для финансового управления Моравией была учреждена особая камера или казённая палата, а при проведении судебных реформ 1783 г. для Моравии и Силезии устроен был особый апелляционный суд. В 1743 г. Мария-Терезия приказала перевезти чешскую корону в Вену, а сын её Иосиф II не нашёл нужным короноваться короной св. Вацлава. Император Леопольд II велел возвратить чешскую корону в Прагу, где она доселе хранится в капелле св. Вацлава как святыня народа чешского и драгоценный залог будущего. Сам Леопольд II и все его преемники, кроме последнего (ныне царствующего Франца-Иосифа), короновались короной св. Вацлава.
В XVI веке начинается новый прилив немецкой колонизации, которой благоприятствовали дружественные отношения чехов к протестантам Германии и распространение в Ч. лютеранства. Усилению немецкого элемента особенно способствовали обстоятельства и события, последовавшие за Белогорской катастрофой. Конфискации Фердинанда II привели к переходу огромного числа земель в руки иностранцев, которые охотно заселяли свои земли выходцами из Германии и основывали новые немецкие колонии на своих опустевших землях. Успехам немецкого языка содействовало и то обстоятельство, что для сношения с Веной, где пребывали центральные органы управления, необходимо было знание немецкого языка. Кто из чехов хотел иметь успех в служебной карьере, тот должен был прежде всего владеть немецким языком, как своим родным. Чешская знать, находившаяся в постоянных сношениях с немецким двором в Вене, подавала в этом отношении пример. Многие чешские паны так онемечивались, что забывали свой родной язык. Хотя иезуиты, быстро распространившиеся в Ч. (вскоре после 1620 г. они имели уже 13 коллегий, а из земель чешской короны была образована отдельная орденская провинция), не были принципиальными врагами чешского языка, но косвенно они вместе с другими миссионерами способствовали его упадку, истреблением чешских книг и рукописей, которые они, отчасти но невежеству, отчасти по слепой ревности к вере, считали еретическими. В 1784 немецкий язык окончательно стал языком преподавания в гимназиях и пражском университете, взамен латинского языка. Во всех правительственных учреждениях также введён был немецкий язык.
Частный кружок чешских патриотов и учёных, собиравшихся с 1769 г. на заседания в Праге, в доме графа Ностица (на Малой Стороне), получил в 1784 г. официальное признание под именем королевского чешского общества наук. Так возникло старейшее учёное общество в Австрии, и доныне продолжающее с достоинством и успехом трудиться в области естественно-математических и историко-филологических наук.
В 1792 император Леопольд II учредил в пражском университете кафедру чешского языка. В 1793 г. чешские патриоты, в числе 33 человек, подали петицию о введении чешского языка при прениях в сейме. В 1818 г. основано было общество чешского музея, всевозможные научные коллекции и библиотека которого с течением времени достигли замечательной полноты и богатства. В 1831 г. при чешском музее возникла чешская Матица, имеющая своей целью разработку языка и литературы, а равно издание учёных сочинений, написанных на чешском языке. Это национальное возрождение ещё более окрепло и принесло богатые плоды во второй половине XIX в., когда крестьяне, составлявшие главную массу чешского народа, были освобождены от крепостной зависимости, и вся общественная и государственная организация после падения старого порядка была перестроена на более широких и свободных основаниях.
Когда началась европейская революция 1848 года, в Чехии наступила пора политических волнений. Сходки и совещания представителей всех классов общества в Праге, начавшиеся с 11 марта 1848 года, не привели к открытому восстанию только вследствие уступчивости правительства и умеренного образа действий наместника.
Тогда же организованы были народная милиция и особый народный комитет. Сначала чехи и немцы действовали единодушно, но вскоре сказались различия в их стремлениях и политике. Комитет, занимавшийся во Франкфурте выработкой конституции для всей Германской империи, к которой причислялась и Чехи, стремился к созданию единого государства. Этому вполне сочувствовали чешские немцы, но иначе на это смотрели чехи.
Когда франкфуртский комитет пригласил историка Палацкого принять участие в заседаниях на правах члена, то последний категорически отказался от этого, усматривая в замыслах комитета опасность не только для чехов, но и для всего австрийского государства. Тем не менее министерство Пиллерсдорфа приказало произвести выборы представителей во франкфуртский сейм. Народный комитет протестовал против этих выборов, но немецкие его члены не присоединились к этому протесту: они выступили из состава комитета и образовали отдельный конституционный союз. Прибывшие от франкфуртского комитета уполномоченные держали себя заносчиво, требуя от чехов посылки депутатов и позволяя себе даже угрозы. Это вызвало всеобщее негодование среди чехов: чешские студенты разогнали немецкий конституционный союз, а народный комитет разослал ко всем славянским племенам австрийского государства приглашение на съезд в Прагу для обсуждения общественных нужд и выработки общей программы действий. Выборы депутатов во франкфуртский сейм состоялись только в округах, заселённых немцами.
Граф Тун, наместник Чехии, чешский патриот, не дождавшись разрешения из Вены от враждебного чехам министерства Пиллерсдорфа, назначил 17 мая выборы в чешский сейм. Между тем в Вене произошли беспорядки, побудившие императора уехать из Вены в Инсбрук. В Венгрии и Ломбардии вспыхнуло открытое восстание. В этот критический для Габсбургов момент только славяне оставались опорой престола. В Венгрии началось, под предводительством бана Йелачича, движение славянских народов, направленное против мадьярских домогательств, опасных для славян. В Чехии был учреждён особый совет наместника, в составе семи главнейших членов народного комитета, и два его члена (Ригер и Ностиц) посланы в Инсбрук к императору испросить утверждение этой меры и назначение дня для открытия заседаний чешского сейма. В Праге закипела оживлённая и плодотворная работа: происходили заседания славянского съезда (со 2 июня), а народный комитет с успехом трудился над выработкой плана будущей земской конституции и окончанием других подготовительных работ для чешского сейма. Все эти добрые начинания погибли по вине представителей крайних мнений и увлечённой ими молодёжи, которая произвела в Праге восстание с 12 июня по 16 июня. Главнокомандующий князь Виндишгретц подавил восстание силой оружия (бомбардировка города 16 июня) и заставил восставших сдаться без всяких условий (17 июня). Славянский съезд разошёлся, не окончив своих заседаний, созыв конституционного чешского сейма был отменён, народный комитет распущен. Вместо того были произведены через несколько дней после усмирения Праги выборы в имперский сейм, где депутаты от чехов образовали правую и поддерживали правительство, стоя на страже целости и самостоятельности государства против франкфуртских и мадьярских домогательств, а депутаты от чешских немцев все примкнули к левой.
Когда в Вене вспыхнула октябрьская революция, чешские депутаты добились у двора, переехавшего в Ольмюц, продолжения заседаний имперского сейма в моравском городе Кромериже (Кремзире). Заседания начались 22 ноября. Несколько дней спустя император Фердинанд отказался от престола в пользу своего 18-летнего племянника Франца-Иосифа I (2 декабря 1848 года). Успешные военные действия Виндишгреца против восставших мадьяр укрепили правительство в мысли самостоятельно выработать конституцию: 4 марта 1849 года Франц-Иосиф опубликовал общую для всего государства конституцию и распустил сейм. Вскоре были осуществлены правительством необходимые реформы: последовало освобождение крестьян от крепостной зависимости; издан новый устав городского и сельского управления; университетам предоставлена известная доля автономии и т. д. Победы Радецкого в Ломбардии и подавление мадьярского восстания при помощи русских войск, посланных императором Николаем I, склонили правительство восстановить старый порядок государственного управления: 31 декабря 1851 года Франц-Иосиф отменил конституцию 1849 года, которая, впрочем, и не была введена. Настала общая реакция (министерство Баха), а в Чехии — преследование журналистов (заключение в тюрьму Гавличка за его политические сатиры), покровительство немцам и стеснение чешского народного движения. Финансовый кризис и неблагоприятный исход войны 1859 года с Сардинией и Францией заставили правительство изменить политику.
20 октября 1860 г. был издан диплом, известный под именем октябрьского, которым были признаны исторические права отдельных земель и равноправность австрийских народов на основе самоуправления. Изданный в исполнение этого диплома патент 26 февраля 1861 г., определяющий организацию земского управления и известный под именем февральского устава, был проникнут, однако, централистическим духом и далеко не соответствовал ожиданиям чехов, мечтавшим о восстановлении прав короны св. Вацлава. Тем не менее они послали своих депутатовкак в земский сейм (ландтаг), созванный весной 1861 г., так и в имперский сейм (рейхсрат), где их депутаты примкнули к полякам и выступили против конституционной централизации министерства Шмерлинга. В частности чехи были недовольны организацией выборов, благоприятной для немцев. Не добившись образования в рейхсрате федеративного большинства, чешские депутаты, заявив протест, оставили палату (1863) и сосредоточили свою деятельность в земском сейме, где им принадлежало большинство. Большие надежды они возлагали на падение министерства Шмерлинга и на новое министерство Белькреди. Действительно, было приостановлено действие февральского устава и издан закон об обязательном преподавании в средних учебных заведениях обоих земских языков (18 января 1866 г.). Закон этот чешские немцы прозвали принудительным (Sprachenzwangsgesetz).